Slide 1

WoLF PSORTサーバの使い方

WoLF PSORTについて

wolfpsort.orgへ

日本語の説明文章へのリンク

予測結果の見本へ

予測結果のSummary表示(1)

予測結果のSummary表示(2)

予測結果のSummary表示(3)

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詳細表示へ

予測結果の詳細表示

WoLF PSORT詳細表示の構成

類似蛋白質リスト

配列アライメントを見る

類似蛋白質とのアラインメント

アライメントから局在化ヒント

類似度の高い蛋白質を調べてみる

転写因子：核局在と合致

Uniprotの局在記述

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Gene Ontologyの局在記述

ＧＯ記述の根拠コード

ＧＯ記述の根拠分類

予測を行なう準備：生物種の選択

練習用のアミノ酸配列へ

配列をマウスで選択する

アミノ酸配列を張り付け、予測させる

詳細表示ページまで進む

特徴量の表まで下がる

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仮想実験の準備

配列の一行目を選択する

Ｎ末端から60残基を消す

予測結果を見る

Ｎ末端を欠損させた配列の類似度蛋白質リスト

天然配列とのアラインメントを見てみる

Ｎ末端の欠損を確認

類似蛋白質リストに戻る

天然配列とＮ末端を欠損させた配列の予測結果比較

予測結果比較から得られる考察

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天然蛋白質の特徴量詳細表を見る

特徴量詳細表を詳しく見る

目に留まる点

システイン含量と分泌蛋白質

正規化されていない特徴量も表示される

特徴量説明へのリンク

特徴量の説明

特徴量レベルでＮ末端欠損の影響を見る

新しいウィンドウを開く

ウィンドウを並べる

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Ｎ末端欠損配列詳細結果表のURIをコピーする準備

ウィンドウの順序を変える

URIを新しいウィンドウへコピーする

ふたつの特徴量表を表示させる操作

特徴量の比較

特徴量比較の考察

局在化と因果関係について